Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scarb2O35114 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scarb2O35114 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarb2O35114 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarb2O35114 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scarb2O35114 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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