Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dctn1O08788 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms