Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CckarO08786 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CckarO08786 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CckarO08786 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CckarO08786 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CckarO08786 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CckarO08786 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CckarO08786 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckarO08786 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms