Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnabL7MTU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms