Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm21310J3QQ23 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm21310J3QQ23 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm21310J3QQ23 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm21310J3QQ23 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm21310J3QQ23 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21310J3QQ23 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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