Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp616J3QN14 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp616J3QN14 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp616J3QN14 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms