Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20873J3QMQ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm20873J3QMQ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20873J3QMQ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm20873J3QMQ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20873J3QMQ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20873J3QMQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20873J3QMQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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