Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21820J3KMU2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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