Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20830J3KML6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20830J3KML6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20830J3KML6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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