Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AK157302I3ITR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AK157302I3ITR1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AK157302I3ITR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms