Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HrcG5E8J6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HrcG5E8J6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HrcG5E8J6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms