Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r12G5E8G1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms