Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pcf11G3X9Z4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcf11G3X9Z4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms