Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfgef1G3X9K3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms