Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3tc1G3X9F6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc1G3X9F6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms