Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610008E11RikG3X964 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610008E11RikG3X964 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610008E11RikG3X964 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms