Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17455G3UW87 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17455G3UW87 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms