Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms