Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dcdc2bF7BCK0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcdc2bF7BCK0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcdc2bF7BCK0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms