Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp946F6VWU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms