Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933403O08RikF6UK53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933403O08RikF6UK53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms