Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn5F6UCX4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn5F6UCX4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn5F6UCX4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms