Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3072F6SKY8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3072F6SKY8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms