Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms