Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms