Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Urb2E9Q7L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Urb2E9Q7L1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms