Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FancfE9Q5Z5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FancfE9Q5Z5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms