Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhb9E9Q5G2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms