Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BC005561E9Q5E2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BC005561E9Q5E2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms