Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ApobE9Q414 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms