Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Acbd4E9Q289 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acbd4E9Q289 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms