Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms