Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3095E9Q058 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms