Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fndc1E9Q043 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms