Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcdh10E9PXQ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pcdh10E9PXQ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh10E9PXQ7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms