Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
9530053A07RikE9PVG8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9530053A07RikE9PVG8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms