Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc62E9PVD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc62E9PVD1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms