Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc17E9PVB5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.7 ms