Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgaE9PV24 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgaE9PV24 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms