Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms