Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Soga1E1U8D0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms