Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430403G16RikD3Z5L4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms