Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hfm1D3Z4R1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hfm1D3Z4R1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms