Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3676D3Z236 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3676D3Z236 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms