Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc6D3YZP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms