Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SafbD3YXK2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SafbD3YXK2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms