Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syce3B5KM66 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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