Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms