Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hbb-bh2B2RVB7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms