Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprbB2RU80 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprbB2RU80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms